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自动菌落计数仪采用全封闭暗箱，隔绝环境光的干扰，*消除杂散光在玻璃培养皿折射形成的光斑、光环现象，为菌落计数提供了良好的光影条件。
照明系统
可见光采用3色LED模拟自然光，上光源具有环绕360度无影照射功能，为菌落成像提供*、立体、清晰的成像效果。下光源采用悬浮式暗视野装置，该装置将培养皿置于空间悬浮状态，利用光的折射和反射，形成菌落的空间立体影像，从而实现对微小菌落的透视和高清晰观察。
菌落计数
菌落显示方式的调节功能，包括颗粒轮廓、颗粒序号和颗粒填充，可以按用户需要进行颜色设置。
一键统计
10模式一键计数
快速菌落统计：
单一颜色快速统计：对单色菌落、多色菌落、小菌落、大菌落、颜色菌落和蔓延菌进行快速统计。
多色菌自动叠加计数：用取色笔对目标菌落颜色提取，即可自动分割出所选区域内所有相同颜色菌落，该算法适用于特定颜色菌落的快速统计。
微小菌统计：适应于微小菌落的统计。
特大菌统计：区域内大菌落的快速统计，该算法偏重于大菌落统计。
与背景色相似菌统计：区域内菌落与培养皿背景颜色相似时，采用背景色相似菌统计。
黏连菌统计：适用于背景颜色单一、菌落颜色不*且边缘模糊的菌落快速统计。
分散菌统计：对边缘清晰，分散的菌落进行快速统计。
网格滤膜：包括3M纸片菌落统计、滤膜纸片菌落统计、实线纸片菌落统计。
显示菌落统计结果，包括菌落总数、菌落形态、分类统计。菌落形态包括每个菌落的编号、位置、等效直径、周长、面积、圆度、短径和长径。分类统计根据菌落的直径把菌落分成25个类别，用户可以直观地查看每个类别的菌落总数。
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自动菌落计数仪适应于微小菌落的统计